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两百年日历

常用工具、信息(欢迎各位使用、掌握乃至精通)
    内网使用的生物信息学系列程序[屈武斌设计并维护,@v100服务器]
  1. 引物质量评估系统 MFEprimer
  2. 多重PCR引物设计系统 MPprimer
  3. 虚拟电泳图生成程序 VE
  4. 载体序列切除程序 vector_away
  5. Blast via Server @ zcglab[对本地数据库检索进行序列相似性分析] [内网使用,v252服务器]
  6. EMBOSS服务器:全套生物信息学数据分析工具 [内网使用,v252服务器]
  7. The Sequence Manipulation Suite [内网使用,v252服务器]
  8. CGI自由测试空间:供生物信息组测试CGI脚本 [内网使用,v252服务器]
  9. [内网] Primer3Plus: 基于Primer3和MFEprimer的PCR引物设计与评估系统 (屈武斌设计)
  10. NetAffx本地化查询(屈武斌调试完成)
  11. primer3_web:引物设计系统 (可从文件列表中选择 input.html)(by Steve Rozen and Whitehead Institute for Biomedical Research.)
  12. 新增功能:工作汇报目录下文件列表(根据时间反向排序,用于新提交文件的快速审核)
  13. 本地化TRANSFAC数据库(for 转录因子分析。问题咨询:杭兴宜)[ver11.1] [ver10.2]
  14. weblogo服务{用于创建序列比对优势位点}
  15. EST/cDNA序列电子延伸系统
  16. cDNA/genome序列分析工具(Exon/intron边界分析)



  1. 多功能两百年日历
  2. 中国图书馆分类法(第四版)生物科学部分简表
  3. NSFC标书写作注意事项
  4. perl 5简明教程
  5. 投稿指南
  6. 服务器使用日志
  7. UCSC Genome Bioinformatics Best Links
  8. Neurosci Lett网站


学习记忆、行为认知相关:

北京硕林苑科技有限公司

科研基金申请:

  1. 文献检索:gateWay
  2. 文献检索:pubMed @ NCBI
  3. 中华人民共和国国家版权局
  4. 国家自然科学基金委(NSFC)
  5. 863计划
  6. 973计划
  7. 国家科技部
  8. 北京科教信息网
  9. 新生命--北京生物医药在线(北京生物技术和新医药产业促进中心)
  10. 中国科学院
  11. 分形世界:孙博文

生物信息学数据分析服务:


    蛋白质二级结构预测
  1. @ NPSA
  2. GOR IV @ NPSA
  3. @ EXPASY

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  5. siRNADesigner
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  7. SwissModel
  8. 台湾杨永正教授:可变剪接数据库
  9. 台湾杨永正的主页
  10. manual of linkage package for Linux
  11. docGuide for me
  12. XML语言
  13. XML Data Standard for Genomics: The Bioinformatic Sequence Markup Language (BSML) DTD

Linux World:

  1. LinuxAid技术支持中心
  2. Mandrake Linux

应用数学与生物信息学工程:

  1. matLab技术支持
  2. Penn State - Bioinformatics Group
  3. Lab of Michael Q. Zhang
  4. Lab of Ming Li @ UCSB
  5. Li Wen-tian
  6. globin Server
  7. 编程知识
  8. Welcome to the GCC home page!
  9. 中国共享软件注册中心
  10. Help for local Perl
  11. Beginning Perl for Bioinformatics

重要资源:

  1. DHL Worldwide Express(敦豪國際有限公司)
  2. DHL Worldwide Express in China
  3. 国家人类基因组北方研究中心
  4. 科学出版社 生命科学编辑部
  5. 浙江大学生理学及神经生物学教研室

e-mail club:

  1. 英语之声
  2. 中国专利信息网

数据分析 @ 张成岗实验室(zcglab):

  1. TMpred - Prediction of Transmembrane Regions and Orientation
  2. TMHMM (v. 2.0): Prediction of transmembrane helices in proteins
  3. Transmembrane Prediction Server: with many server address: DASv1 HMMTOP2.0 MEMSAT1.0 MPEX PHD PSORT (ALOM2) SPLIT-4.0 TMAP TM-Finder TMHMM2.0 TMpred TopPred2
  4. pSort for prediction of protein sub-cellular localization(JAPAN).
  5. 台湾交通大学 黄镇刚,亚细胞定位, CELLO
    Resources @ NCBI:
  6. homePage of NCBI
  7. Entrez
  8. BLAST
  9. human Genome Viewer
  10. human genome 2
  11. OMIM
  12. contig sequence download
  13. homePage of dbSNP
  14. BLAST on dbSNP
  15. SNP server (User ID=73980 password=zhangcg)>
    UCSC
  16. BLAT
  17. geneNetwork
    SMART server:
  18. SMART server
  19. mirror of SMART server
  20. SMART retrieve...
    Resources @ EBI:
  21. interProScan
  22. clustalW
  23. interProScan retrieve...
  24. ProSite
    Genome resources:
  25. Genome Database
  26. GDB searching
  27. TIGR Human Gene Index
  28. Rat Genome Database(RGD)
  29. Mouse Genome Server
  30. mitoDB
  31. sim4: 外显子/内含子边界鉴定
  32. repeatMasker
    Other resources:
  33. FASTA searching
  34. FASTA @ EBI
  35. MatInspector
  36. Register MatInspector
  37. The I.M.A.G.E. Consortium
  38. searching IMAGEne
  39. GENEHUNTER
  40. geneMine
  41. Promoter prediction
  42. 北大生物信息中心
  43. Sequence Analysis @ PKU
  44. 清华大学生物信息学研究所
  45. 谈杰的生物软件网
  46. 生物信息网站评述

文献检索


中国科学引文数据库 超星数字图书馆
PubMed @ NCBI text format of PubMed @ NCBI
medlineBench SCIRUS: for Scientific information only
解放军医学图书馆//[用户名:ixxb 口令:无][网络设置:IE noProxy: 210.77.231.*, *.mlpla.org.cn//TCP/IP: WINS: add: 210.77.231.1]
Ebsco Online[用户名:MLPLA//用户ID:mlpla//口令:reader] Elsevier SDOS China Consortium[使用无限制!]
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网上电子期刊: 荷兰SWETS: 用户名:swets.trial//口令:elf

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生物信息学__基因和蛋白质分析的实用指南
生物信息学_黄英武_过涛

新书介绍


《生物信息学方法与实践》, 36万字, 作者:张成岗、贺福初, 科学出版社,2002年6月底出版
科学出版社//生物信息学系列图书